Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700122O11RikJ3QPW6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700122O11RikJ3QPW6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700122O11RikJ3QPW6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700122O11RikJ3QPW6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700122O11RikJ3QPW6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700122O11RikJ3QPW6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms