Protein–RNA interactions for Protein: J3QP72

Gm21738, Predicted gene, 21738, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21738J3QP72 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21738J3QP72 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21738J3QP72 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21738J3QP72 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21738J3QP72 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms