Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Trim34bJ3QNR8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Trim34bJ3QNR8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Trim34bJ3QNR8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trim34bJ3QNR8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trim34bJ3QNR8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trim34bJ3QNR8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Trim34bJ3QNR8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Trim34bJ3QNR8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trim34bJ3QNR8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Trim34bJ3QNR8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Trim34bJ3QNR8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27,57■■■□□ 2
Trim34bJ3QNR8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Trim34bJ3QNR8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Trim34bJ3QNR8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms