Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam240aJ3QNP9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam240aJ3QNP9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms