Protein–RNA interactions for Protein: J3QMB3

Fam240b, Family with sequence similarity 240 member B, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240bJ3QMB3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam240bJ3QMB3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam240bJ3QMB3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam240bJ3QMB3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam240bJ3QMB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam240bJ3QMB3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam240bJ3QMB3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam240bJ3QMB3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam240bJ3QMB3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms