Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20828J3KMI7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20828J3KMI7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20828J3KMI7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20828J3KMI7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms