Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp408H7BX78 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp408H7BX78 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp408H7BX78 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp408H7BX78 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp408H7BX78 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms