Protein–RNA interactions for Protein: H3BKT1

Uncharacterized protein C19orf84 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BKT1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H3BKT1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H3BKT1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H3BKT1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H3BKT1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H3BKT1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
H3BKT1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H3BKT1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H3BKT1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H3BKT1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H3BKT1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H3BKT1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H3BKT1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H3BKT1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H3BKT1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H3BKT1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H3BKT1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H3BKT1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H3BKT1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H3BKT1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H3BKT1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H3BKT1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H3BKT1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H3BKT1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H3BKT1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3BKT1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3BKT1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3BKT1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3BKT1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3BKT1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3BKT1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H3BKT1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H3BKT1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H3BKT1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H3BKT1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H3BKT1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H3BKT1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H3BKT1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H3BKT1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H3BKT1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H3BKT1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H3BKT1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3BKT1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H3BKT1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H3BKT1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BKT1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BKT1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BKT1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BKT1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BKT1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BKT1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BKT1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BKT1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BKT1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BKT1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BKT1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BKT1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BKT1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BKT1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BKT1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BKT1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BKT1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BKT1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BKT1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BKT1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BKT1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BKT1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BKT1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BKT1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BKT1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BKT1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BKT1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BKT1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BKT1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BKT1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H3BKT1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BKT1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BKT1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BKT1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H3BKT1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BKT1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BKT1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BKT1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BKT1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BKT1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BKT1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BKT1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H3BKT1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BKT1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BKT1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BKT1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BKT1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H3BKT1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BKT1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BKT1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BKT1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BKT1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BKT1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BKT1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H3BKT1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms