Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tubgcp6G5E8P0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tubgcp6G5E8P0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tubgcp6G5E8P0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Tubgcp6G5E8P0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tubgcp6G5E8P0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Tubgcp6G5E8P0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tubgcp6G5E8P0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tubgcp6G5E8P0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tubgcp6G5E8P0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tubgcp6G5E8P0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tubgcp6G5E8P0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tubgcp6G5E8P0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tubgcp6G5E8P0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms