Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmgxb3G3X9M3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmgxb3G3X9M3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmgxb3G3X9M3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgxb3G3X9M3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms