Protein–RNA interactions for Protein: G3X904

Zfp275, Zinc finger protein 275, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp275G3X904 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp275G3X904 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp275G3X904 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp275G3X904 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp275G3X904 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp275G3X904 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp275G3X904 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zfp275G3X904 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp275G3X904 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp275G3X904 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp275G3X904 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp275G3X904 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp275G3X904 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp275G3X904 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp275G3X904 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp275G3X904 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms