Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
2210016F16RikG3X8U3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
2210016F16RikG3X8U3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
2210016F16RikG3X8U3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2210016F16RikG3X8U3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms