Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp72F8VQC1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp72F8VQC1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp72F8VQC1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp72F8VQC1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp72F8VQC1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp72F8VQC1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp72F8VQC1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp72F8VQC1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp72F8VQC1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srp72F8VQC1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp72F8VQC1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp72F8VQC1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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