Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colca2F8VPY8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colca2F8VPY8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Colca2F8VPY8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Colca2F8VPY8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142 ms