Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc149F6V035 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc149F6V035 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc149F6V035 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc149F6V035 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms