Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sptbn5F6UCX4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sptbn5F6UCX4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sptbn5F6UCX4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sptbn5F6UCX4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms