Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3072F6SKY8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3072F6SKY8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm3072F6SKY8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm3072F6SKY8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3072F6SKY8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3072F6SKY8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3072F6SKY8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms