Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610001J05RikF2Z3Y9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2610001J05RikF2Z3Y9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2610001J05RikF2Z3Y9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms