Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc74aE9Q9U8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc74aE9Q9U8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc74aE9Q9U8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc74aE9Q9U8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc74aE9Q9U8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc74aE9Q9U8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms