Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mcmdc2E9Q956 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mcmdc2E9Q956 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.54■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mcmdc2E9Q956 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mcmdc2E9Q956 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms