Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r35E9Q7U8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r35E9Q7U8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r35E9Q7U8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r35E9Q7U8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms