Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Arhgef5E9Q7D5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Arhgef5E9Q7D5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Arhgef5E9Q7D5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Arhgef5E9Q7D5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Arhgef5E9Q7D5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Arhgef5E9Q7D5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Arhgef5E9Q7D5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Arhgef5E9Q7D5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Arhgef5E9Q7D5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Arhgef5E9Q7D5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Arhgef5E9Q7D5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Arhgef5E9Q7D5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Arhgef5E9Q7D5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Arhgef5E9Q7D5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Arhgef5E9Q7D5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Arhgef5E9Q7D5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Arhgef5E9Q7D5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Arhgef5E9Q7D5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Arhgef5E9Q7D5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Arhgef5E9Q7D5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Arhgef5E9Q7D5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Arhgef5E9Q7D5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Arhgef5E9Q7D5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Arhgef5E9Q7D5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Arhgef5E9Q7D5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Arhgef5E9Q7D5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
Arhgef5E9Q7D5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Arhgef5E9Q7D5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Arhgef5E9Q7D5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Arhgef5E9Q7D5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Arhgef5E9Q7D5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Arhgef5E9Q7D5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Arhgef5E9Q7D5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms