Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtproE9Q612 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtproE9Q612 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms