Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
BC005561E9Q5E2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
BC005561E9Q5E2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
BC005561E9Q5E2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BC005561E9Q5E2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
BC005561E9Q5E2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
BC005561E9Q5E2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms