Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CenpfE9Q3P4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpfE9Q3P4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpfE9Q3P4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpfE9Q3P4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpfE9Q3P4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms