Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nup153E9Q3G8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nup153E9Q3G8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup153E9Q3G8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup153E9Q3G8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup153E9Q3G8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup153E9Q3G8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nup153E9Q3G8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Nup153E9Q3G8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nup153E9Q3G8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nup153E9Q3G8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nup153E9Q3G8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nup153E9Q3G8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nup153E9Q3G8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms