Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Tarbp1E9Q368 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Tarbp1E9Q368 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Tarbp1E9Q368 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tarbp1E9Q368 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Tarbp1E9Q368 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tarbp1E9Q368 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms