Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
5430401F13RikE9Q328 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
5430401F13RikE9Q328 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430401F13RikE9Q328 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5430401F13RikE9Q328 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5430401F13RikE9Q328 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5430401F13RikE9Q328 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5430401F13RikE9Q328 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
5430401F13RikE9Q328 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
5430401F13RikE9Q328 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430401F13RikE9Q328 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430401F13RikE9Q328 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430401F13RikE9Q328 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms