Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdr1E9Q0B4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdr1E9Q0B4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr1E9Q0B4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms