Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Fndc1E9Q043 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Fndc1E9Q043 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fndc1E9Q043 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fndc1E9Q043 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fndc1E9Q043 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fndc1E9Q043 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms