Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E430018J23RikE9PZQ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E430018J23RikE9PZQ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E430018J23RikE9PZQ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms