Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Scaf11E9PZM7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Scaf11E9PZM7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Scaf11E9PZM7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Scaf11E9PZM7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Scaf11E9PZM7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Scaf11E9PZM7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Scaf11E9PZM7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Scaf11E9PZM7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Scaf11E9PZM7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Scaf11E9PZM7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms