Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 662 ms