Protein–RNA interactions for Protein: D3YYH9

Gm498, Predicted gene 498, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm498D3YYH9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm498D3YYH9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm498D3YYH9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm498D3YYH9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm498D3YYH9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms