Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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