Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pnldc1B2RXZ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnldc1B2RXZ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms