Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol7aB2RT54 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apol7aB2RT54 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol7aB2RT54 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms