Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm2012B1B0R1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2012B1B0R1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2012B1B0R1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2012B1B0R1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms