Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssxb8B1AY40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssxb8B1AY40 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssxb8B1AY40 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssxb8B1AY40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms