Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930402K13RikB1AW18 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930402K13RikB1AW18 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930402K13RikB1AW18 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930402K13RikB1AW18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930402K13RikB1AW18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
4930402K13RikB1AW18 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930402K13RikB1AW18 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930402K13RikB1AW18 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930402K13RikB1AW18 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930402K13RikB1AW18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4930402K13RikB1AW18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930402K13RikB1AW18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930402K13RikB1AW18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930402K13RikB1AW18 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms