Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssxa1B1AUS7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssxa1B1AUS7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssxa1B1AUS7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
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