Protein–RNA interactions for Protein: A9YVJ5

Gbp11, Guanylate binding protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp11A9YVJ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp11A9YVJ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp11A9YVJ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp11A9YVJ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp11A9YVJ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp11A9YVJ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp11A9YVJ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms