Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pfkfb3A7UAK5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pfkfb3A7UAK5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pfkfb3A7UAK5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pfkfb3A7UAK5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pfkfb3A7UAK5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms