Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930435E12RikA6X8Z9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930435E12RikA6X8Z9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
4930435E12RikA6X8Z9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms