Protein–RNA interactions for Protein: A6H5Y3

Mtr, Methionine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrA6H5Y3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
MtrA6H5Y3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MtrA6H5Y3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MtrA6H5Y3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MtrA6H5Y3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms