Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SetxA2AKX3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SetxA2AKX3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SetxA2AKX3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SetxA2AKX3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms