Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ambra1A2AH22 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ambra1A2AH22 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ambra1A2AH22 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ambra1A2AH22 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms