Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm11A2AGX3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm11A2AGX3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm11A2AGX3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm11A2AGX3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm11A2AGX3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm11A2AGX3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm11A2AGX3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm11A2AGX3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm11A2AGX3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm11A2AGX3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm11A2AGX3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm11A2AGX3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm11A2AGX3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prdm11A2AGX3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms