Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms