Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbbp8nlA2ABX0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms